Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sap30O88574 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sap30O88574 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sap30O88574 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sap30O88574 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sap30O88574 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sap30O88574 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Sap30O88574 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sap30O88574 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sap30O88574 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Sap30O88574 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sap30O88574 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sap30O88574 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sap30O88574 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sap30O88574 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Sap30O88574 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Sap30O88574 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sap30O88574 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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