Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfdp1O88271 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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