Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TsksO54887 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TsksO54887 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TsksO54887 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TsksO54887 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms