Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
CrxO54751 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
CrxO54751 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms