Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cited2O35740 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms