Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Kcns1O35173 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kcns1O35173 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Kcns1O35173 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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