Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sema3aO08665 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms