Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MttpO08601 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MttpO08601 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MttpO08601 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MttpO08601 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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