Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E2

Gm8271, Predicted gene 8271, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8271L7N2E2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8271L7N2E2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms