Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3278L7N2D2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3278L7N2D2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3278L7N2D2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3278L7N2D2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3278L7N2D2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm3278L7N2D2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm3278L7N2D2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm3278L7N2D2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3278L7N2D2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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