Protein–RNA interactions for Protein: L7N216

Speer4d, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4D, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4dL7N216 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Speer4dL7N216 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer4dL7N216 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Speer4dL7N216 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Speer4dL7N216 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Speer4dL7N216 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Speer4dL7N216 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Speer4dL7N216 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Speer4dL7N216 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Speer4dL7N216 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Speer4dL7N216 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Speer4dL7N216 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Speer4dL7N216 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Speer4dL7N216 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer4dL7N216 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms