Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm379J3QQ19 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms