Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms