Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm2035J3QP87 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm2035J3QP87 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm2035J3QP87 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm2035J3QP87 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2035J3QP87 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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