Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21900J3QP38 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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