Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6176J3QK59 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms