Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tmem200cJ3QK46 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms