Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm21060J3KMU4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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