Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r58G3X9U3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms