Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm16519F8VQK7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms