Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9yF8VPU6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms