Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmod3E9QA62 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms