Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srp54bE9PXC0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srp54bE9PXC0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms