Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb3D3Z6J4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms