Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms