Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm3543D3Z235 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm3543D3Z235 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms