Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Syce3B5KM66 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce3B5KM66 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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