Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ankrd34aB2RW11 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ankrd34aB2RW11 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms