Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Clrn2B2RVW2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clrn2B2RVW2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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