Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms