Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AU015836B2RUM3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AU015836B2RUM3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms