Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf1bp1B2KF50 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms