Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trabd2bB1ATG9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Trabd2bB1ATG9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Trabd2bB1ATG9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trabd2bB1ATG9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms