Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms