Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Palm3A2TJV2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms