Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms