Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ambra1A2AH22 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms