Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34dA2AGU5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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