Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frmpd4A2AFR3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms