Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5538W4VSP6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms