Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Top3bQ9Z321 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms