Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms