Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms