Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cldn7Q9Z261 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn7Q9Z261 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms