Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nek4Q9Z1J2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms