Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slfn1Q9Z0I7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slfn1Q9Z0I7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms