Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rnf4Q9QZS2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Rnf4Q9QZS2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf4Q9QZS2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf4Q9QZS2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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