Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms