Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trpc5Q9QX29 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms