Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rabgef1Q9JM13 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rabgef1Q9JM13 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms